教育经历
2005-2009 法国巴黎第十一大学，细胞与分子遗传学专业，博士
2002-2005 华东师范大学，生命科学学院，硕士
1996-2000 烟台师范学院，生物系，本科，学士
工作经历
2019- 今 武汉大学生命科学学院, 副研究员
2014-2018 中国科学院上海植物生理生态研究所 副研究员
2009-2014 中国科学院上海植物生理生态研究所 助理研究员
承担课程
本科生：《生物化学技术》和《生物化学实验》
学术兼职
2023- 今 武汉生物物理学会理事
研究领域
RNA剪接是转录后RNA加工的必需步骤，也是高等生物基因表达调控的重要手段。一方面，精确的RNA剪接动态调控与细胞分化、器官个体发育等生命过程密切相关。另一方面，剪接体组分、RNA顺式元件和反式作用因子的突变可以导致包括癌症、神经退行性疾病等多种人类疾病。我们致力于研究RNA剪接的发生机制及其在个体发育与疾病中的调控功能，主要研究方向包括：
1）RNA剪接在神经和性别发育中的调控作用;
2）环状RNA的生成与调控机制及其在个体发育与疾病中的功能。
科研项目
主持项目：
2016-2019 国家自然科学基金委，面上项目，果蝇发育中的U12型剪接调控；
2011-2013 国家自然科学基金青年项目，DOA激酶与SRm160互作对RNA剪接的影响及其在发育调控中的作用；
2010-2012 中国科学院上海生命科学研究院优秀青年人才领域前沿项目，MAPK信号通路对果蝇发育中SRm160功能的调节作用。
参与项目：
2023-2025 国家自然科学基金委，国际合作与交流项目“染色质骨架蛋白调控反式剪接、可变剪接和可变多腺苷酸化的新功能与机制研究”，主要参与人；
2021-2026 科技部，国家重点研发计划，纤维化进程中组织器官互作紊乱导致干细胞转录失调；
2015-2018 中国科学院重点部署项目，剪接体复合物的高效表达系统与作用机制研究；
2015-2017 国家自然科学基金委，重大研究计划培育项目, 长非编码RNA的剪接调控机制研究。
代表性论文 （#: 共同第一作者; *: 共同通讯作者）
1) Li H#, Ding Z#, Fang ZY#, Long N, Ang HY, Zhang Y, Fan YJ*, and Xu YZ*. Conserved intronic secondary structures with concealed branch sites regulate alternative splicing of poison exons. Nucleic Acids Research, 2024, DOI: 10.1093/nar/gkae185, PMID: 38499485.
2) Wang M#, Liang AM#, Zhou ZZ, Pang TL, Fan YJ*, and Xu YZ*. Deletions of singular U1 snRNA gene significantly interfere with transcription and 3'-end mRNA formation. PLOS Genetics, 2023, 19(11): e1011021, PMID: 37917726.
3) Fan YJ# *, Ding Z#, Zhang Y#, Su R, Yue JL, Liang AM, Huang QW, Meng YR, Li M, Xue Y, and Xu YZ*. Sex-lethal regulates back-splicing and generation of the sex-differentially expressed circular RNAs. Nucleic Acids Research, 2023, 51(10): 5228-5241, PMID: 37070178.
4) Zhang B, Ding Z, Li L, Xie LK, Fan YJ, and Xu YZ*. Two oppositely-charged sf3b1 mutations cause defective development, impaired immune response, and aberrant selection of intronic branch sites in Drosophila. PLoS Genetics, 2021, 17(11): e1009861, PMID: 34723968.
5) Li L, Ding Z, Pang T-L, Zhang B, Li C-H, Liang A-M, Wang Y-R, Zhou Y, Fan YJ* and Xu YZ*. Defective Minor Spliceosomes Induce SMA-associated phenotypes through Sensitive Intron-Containing Neural Genes in Drosophila. Nature Communications, 2020, 11(1): 5608, PMID: 33154379. Recommended in the focus of “From Brain to Behaviour”.
6) Shao W, Ding Z, Zheng ZZ, Shen JJ, Shen YX, Pu J, Fan YJ, Query CC* and Xu YZ*. Prp5–Spt8/Spt3 interaction mediates a reciprocal coupling between splicing and transcription. Nucleic Acids Research, 2020, 48: 5799-5813, PMID: 32399566.
7) Lv M#, Yao Y#, Li F, Xu L, Yang L, Gong Q, Xu YZ, Shi Y, Fan YJ* and Tang Y*. Structural insights reveal the specific recognition of roX RNA by the dsRNA-binding domains of the RNA helicase MLE and its indispensable role in dosage compensation in Drosophila. Nucleic Acids Research, 2019, 47(6): 3142-3157, PMID: 30649456.
8) Qiu C#, Zhang Y#, Fan YJ#, Pang TL, Su Y, Zhan S* and Xu YZ*. HITS-CLIP reveals sex-differential RNA binding and alterative splicing regulation of SRm160 in Drosophila. Journal of Molecular Cell Biology, 2019, 11(2): 170–181, PMID: 29750417.
9) Gao JL#, Fan YJ#, Wang XY#, Zhang Y, Pu J, Li L, Shao W, Zhan S, Hao J and Xu YZ*. A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila. Genes & Development, 2015, 29(7):760-771, PMID: 25838544.
10) Fan YJ*, Gittis AH, Juge F, Qiu C, Xu YZ and Rabinow L*. Multifunctional RNA processing protein SRm160 induces apoptosis and regulates eye and genital development in Drosophila, Genetics, 2014, 197(4): 1251-1265, PMID: 24907259.
11) Fan YJ, Schlierf M, Gaspar AC, Dreux C, Kpebe A, Chaney L, Mathieu A, Hitte C, Grémy O, Sarot E, Horn M, Zhao YL, Kinzy TG and Rabinow L. Drosophila translational elongation factor-1gamma is modified in response to DOA kinase activity and is essential for cellular viability, Genetics, 2010, 184(1):141-154, PMID: 19841092.
