学习经历
2003.09-2007.06 华中农业大学，生命科学技术学院，国家生命科学与技术基地班，学士
2007.09-2012.12 华中农业大学，生命科学技术学院，作物遗传改良国家重点实验室，博士
主要工作经历与任职情况
2013.01-2013.12 华中农业大学，作物遗传改良国家重点实验室，科研助理
2014.01-2018.12 美国威斯康星大学-麦迪逊分校，博士后
2019.01至今， 武汉大学生命科学学院，杂交水稻国家重点实验室，研究员
主要研究领域及兴趣
真核生物的DNA缠绕在组蛋白八聚体上以染色质的形式存在于细胞核中，作为“骨架”的组蛋白上存在着动态的化学修饰，包括乙酰化、甲基化、磷酸化等。这些修饰对染色质的活动（DNA的复制及损伤修复、RNA转录等）有重要的调控作用。我们以模式植物拟南芥和水稻为材料，主要关注：
1.组蛋白修饰调控染色质活动的具体机制。组蛋白修饰与转录等染色质活动的关联已经广为熟知。然而，目前的大部分研究只停留在相关性，例如乙酰化与基因表达激活相关等，其中的因果关系与作用机制并未明确。我们将深入研究组蛋白修饰是如何与RNA聚合酶复合体等染色质上的功能蛋白相互作用，进而调控染色质活动的机制。
2.组蛋白修饰协调环境胁迫与植物发育的机制。植物对环境因素的响应最终表现为特定基因的表达变化。那么环境信号是如何转变为基因表达调控行为的呢？细胞内的遗传信息流是从DNA到RNA，再到蛋白质，最终表现为细胞内的代谢活动，而环境因素的信号很多则从代谢产物开始，传递到蛋白质，再表现为蛋白质调控基因表达，而组蛋白修饰在这两个过程中都扮演了重要的角色。我们将从植物的代谢中间产物入手，研究组蛋白修饰是如何感知环境信号，进而调控基因表达和植物发育的。
主持课题项目
国家自然科学基金面上项目
中央高校自主科研项目
代表性论文
1. Lu Y, Tan F, Zhao Y,Chen X, Zhou S, Hu Y, Zhou DX. A Chromodomain-Helicase-DNA-like Binding Factor Functions in Chromatin Modification and Gene Regulation.Plant Physiol. 2020 May 21:pp.00453.2020.
2. Hu Y, Lai Y,Chen X, Zhou DX, Zhao Y. Distribution pattern of histone marks potentially determines their roles in transcription and RNA processing in rice.J Plant Physiol. 2020 Jun;249:153167.
3.Chen X*, Ding AB, Zhong X*. Functions and mechanisms of plant histone deacetylases.Sci China Life Sci. 2020 Feb;63(2):206-216.
4. Yang L#,Chen X#, Wang Z, Sun Q, Hong A, Zhang A, Zhong X, Hua J. HOS15 and HDA9 negatively regulate immunity through histone deacetylation of intracellular immune receptor NLR genes in Arabidopsis.New Phytol. 2020 Apr;226(2):507-522.
5. Mayer KS#,Chen X#, Sanders D, Chen J, Jiang J, Nguyen P, Scalf M, Smith LM, Zhong X. HDA9-PWR-HOS15 is a core histone deacetylase complex regulating transcription and development.Plant Physiol. 2019;180(1):342-355.
6. Yang Z, Qian S, Scheid RN, Lu L,Chen X, Liu R, Du X, Lv X, Boersma MD, Scalf M, Smith LM, Denu JM, Du J, Zhong X. EBS is a bivalent histone reader that regulates floral phase transition in Arabidopsis.Nat Genet. 2018;50(9):1247-1253.
7. Lu L#,Chen X#, Qian S, Zhong X. The plant-specific histone residue Phe41 is important for genome-wide H3.1 distribution.Nat Commun. 2018;9(1):630.
8.Chen X, Lu L, Qian S, Scalf M, Smith LM, Zhong X. Canonical and Noncanonical Actions of Arabidopsis Histone Deacetylases in Ribosomal RNA Processing.Plant Cell. 201;30(1):134-152.
9.Chen X, Lu L, Mayer KS, Scalf M, Qian S, Lomax A, Smith LM, Zhong X. POWERDRESS interacts with HISTONE DEACETYLASE 9 to promote aging in Arabidopsis.eLife. 2016;5: e17214.
10. Kim YJ, Wang R, Gao L, Li D, Xu C, Mang H, Jeon J,Chen X, Zhong X, Kwak JM, Mo B, Xiao L, Chen X. POWERDRESS and HDA9 interact and promote histone H3 deacetylation at specific genomic sites in Arabidopsis.Proc Natl Acad Sci U S A. 2016;113(51):14858-14863.
11. Lu L,Chen X, Sanders D, Qian S, Zhong X. High-resolution mapping of H4K16 and H3K23 acetylation reveals conserved and unique distribution patterns in Arabidopsis and rice.Epigenetics. 2015;10(11):1044-53.
12.Chen X, Liu X, Zhao Y, Zhou DX. Histone H3K4me3 and H3K27me3 regulatory genes control stable transmission of an epimutation in rice.Sci Rep. 2015;5:13251.
13. Li T,Chen X, Zhong X, Zhao Y, Liu X, Zhou S, Cheng S, Zhou DX. Jumonji C domain protein JMJ705-mediated removal of histone H3 lysine 27 trimethylation is involved in defense-related gene activation in rice.Plant Cell. 2013;25(11):4725-36.
14.Chen X, Zhou DX. Rice epigenomics and epigenetics: challenges and opportunities.Curr Opin Plant Biol. 2013;16(2):164-9.
15. Chen Q#,Chen X#, Wang Q, Zhang F, Lou Z, Zhang Q, Zhou DX. Structural basis of a histone H3 lysine 4 demethylase required for stem elongation in rice.PLoS Genet. 2013;9(1):e1003239.
16.Chen X, Hu Y, Zhou DX. Epigenetic gene regulation by plant Jumonji group of histone demethylase.Biochim Biophys Acta. 2011;1809(8):421-6.
17. Qin FJ, Sun QW, Huang LM,Chen XS, Zhou DX. Rice SUVH histone methyltransferase genes display specific functions in chromatin modification and retrotransposon repression.Mol Plant. 2010;3(4):773-82.
招生招聘
常年接受博士后申请；每年计划招收2名硕士，1名博士，报考请选择遗传学专业方向。
