求学经历:
2005.09-2009.06 贵州大学 农学 学士学位
2009.09-2012.06 西北农林科技大学 作物遗传育种 硕士学位
2012.10-2013.04 德国马普所-植物育种所 植物发育学 博士学生
2013.04-2017.07 德国法兰克福大学 生物学 博士学位
主要工作经历与任职情况:
2017.12-2023.09 特拉维夫大学 博士后
2023.12-至今 武汉大学生命科学学院 教授
2023.12-至今 武汉大学杂交水稻全国重点实验室 PI
主要科研奖励和个人荣誉:
2023年入选“国家优秀青年项目(海外)”
2018年入选以色列优秀“PBC fellowship” 博士后项目
主持课题项目:
2024-2026 国家优秀青年项目(海外)主持
主要研究方向:
1)植物信号小分子的感知、运输分配与环境适应性 2)基因编辑与水稻基因型设计育种
信号分子的运输与分配在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。激素稳态对于平衡植物生长和发育至关重要,并且在多个层面上受到调节,包括激素生物合成、降解代谢、感知和转运。激素转运体对植物激素发挥作用至关重要,这突出表现在它们的功能丧失导致严重的生长和发育缺陷。因此,深入研究植物激素转运的分子机理和空间分布调控具有重要的科学意义。尤其是在植物体内具有动态转运的激素,如生长素,细胞分裂素,脱落酸和油菜素淄醇等。但是,植物基因组的高度冗余性严重的限制了植物转运蛋白遗传与功能的研究。
本课题组在拟南芥和水稻中构建的动态靶向基因组规模CRISPR文库,可解决由于功能冗余而导致的隐藏性遗传变异问题,能极大方便植物科学家和育种家进行广泛的功能筛选,推动植物基因功能研究和加速遗传育种进程。本课题组对调节植物激素以及主要矿质营养转运机制的分子因素感兴趣。本课题组已构建能在基因组规模克服功能冗余的多靶标CRISPR文库,结合正向遗传筛选,采用分子生物学、化学生物学和共聚焦显微镜成像等技术,聚焦于植物激素和主要营养元素转运蛋白的鉴定及其转运机制的剖析研究。拟通过激素生物合成/营养元素感知,运输,空间分布的操纵来优化植物构型(株型和根系结构),释放产量潜力和提高环境适应性与抗逆性提供重要的理论基础;为未来在作物中进一步加强植物激素与营养的转运和空间差异性分布调控的相关基础研究奠定基础。主要研究方向包括:
1) 深入解析植物激素和主要营养元素的感知,转运及稳态的分子调控机制,并阐释它们在调控生长发育,环境感知与应激中的关键作用;
2) 生长素,细胞分裂素等激素与主要营养元素、糖、水分等信号分子交叉调控植物生长发育和逆境响应的分子机制研究;
3) 植物激素与营养元素介导的根系构型可塑性的分子机制;
4) 以在水稻中构建基因组规模的克服功能冗余CRISPR文库,结合有针对性的正向遗传筛选,揭示激素和养分感知、运输与差异性空间分布的分子新机制;同时为水稻重要农艺性状 (如水稻高产,高抗及养分高效利用等) 的协同改良与基因型设计育种奠定基础和提供重要基因资源,以期提高作物育种的效率和创制高产优质多抗新品种。
代表性论文(#并列第一作者,*通讯作者):
Yangjie Hu; Priyanka Patra; Odelia Pisanty; Anat Shafir; Zeinu Mussa Belew; Jenia Binenbaum; Shir Ben Yaakov; Bihai Shi; Laurence Charrier; Gal Hyams; Yuqin Zhang; Maor Trabulsky; Omer Caldararu; Daniela Weiss; Christoph Crocoll; Adi Avni; Teva Vernoux; Markus Geisler; Hussam Hassan Nour-Eldin; Itay Mayrose; Eilon Shani. Multi-Knock—a multi-targeted genome-scale CRISPR toolbox to overcome functional redundancy in plants. Nature Plants, 2023, 9,572-587.
Yangjie Hu* and Eilon Shani*. Cytokinin activity – transport and homeostasis at the whole plant, cell, and subcellular levels. New Phytologist, 2023.
Jian Chen#; Yangjie Hu#; Pengchao Hao; Tashi Tsering; Jian Xia; Yuqin Zhang; Ohad Roth; Maria F Njo; Lieven Sterck; Yun Hu; Yunde Zhao; Danny Geelen; Markus Geisler; Eilon Shani; Tom Beeckman; Steffen Vanneste. ABCB-mediated auxin transport in outer root tissues regulates lateral root spacing in Arabidopsis. EMBO Reports, 2023, e56271.
Yangjie Hu; Moutasem Omary; Yun Hu; Ohad Doron; Lukas Hoermayer; Qingguo Chen; Or Megides; Ori Chekli; Zhaojun Ding; Jiří Friml; Yunde Zhao; Ilan Tsarfaty; Eilon Shani. Cell kinetics of auxin transport and activity in Arabidopsis root growth and skewing. Nature Communications, 2021, 12(1):1657.
Yangjie Hu; Anida Mesihovic; Jose M. Jimenez-Gomez; Sascha Roth; Philipp Gebhardt; Daniela Bublak; Arnaud Bovy; Klaus-Dieter Scharf; Enrico Schleiff and Sotirios Fragkostefanakis. Natural variation in HsfA2 pre‐mRNA splicing is associated with changes in thermotolerance during tomato domestication. New Phytologist, 2020, 225(3), 1297-1310.
Yangjie Hu; Sotirios Fragkostefanakis; Enrico Schleiff; Stefan Simm. Transcriptional basis for differential thermosensitivity of seedlings of various tomato genotypes. Genes, 2020, 11(6), 1-21.
Yana Kazachkova; Itay Zemach; Sayantan Panda; Samuel Bocobza; Andrii Vainer; Ilana Rogachev; Yonghui Dong; Shifra Ben-Dor; Dorottya Veres; Christa Kanstrup; Sophie Konstanze Lambertz; Christoph Crocoll; Yangjie Hu; Eilon Shani; Simon Michaeli; Hussam Hassan Nour-Eldin; Dani Zamir; Asaph Aharoni; The GORKY glycoalkaloid transporter is indispensable for preventing tomato bitterness, Nature plants, 2021, 7: 468-480
Tingting Ding; Feng Zhang; Junxia Wang; Fengxia Wang; Jiajia Liu; Chuantian Xie; Yangjie Hu; Eilon Shani; Xiangpei Kong; Zhaojun Ding; Huiyu Tian; Cell‐type action specificity of auxin on Arabidopsis root growth, The Plant Journal, 2021, 106(4): 928-941
Sotirios Fragkostefanakis; Stefan Simm; Asmaa El‐Shershaby; Yangjie Hu; Daniela Bublak; Anida Mesihovic; Katrin Darm; Shravan Kumar Mishra; Bettina Tschiersch; Klaus Theres; Christian Scharf; Enrico Schleiff; Klaus‐Dieter Scharf; The repressor and co‐activator HsfB1 regulates the major heat stress transcription factors in tomato, Plant Cell Environ, 2018, 42(3): 874- 890
Sotirios Fragkostefanakis; Anida Mesihovic; Stefan Simm; Marine Josephine Paupière; Yangjie Hu; Puneet Paul; Shravan Kumar Mishra; Bettina Tschiersch; Klaus Theres; Arnaud Bovy; Enrico Schleiff; Klaus-Dieter Scharf; HsfA2 Controls the Activity of Developmentally and Stress Regulated Heat Stress Protection Mechanisms in Tomato Male Reproductive Tissues, Plant Physiology, 2016, 170(4): 2461-2477
Mario Keller; Yangjie Hu; Anida Mesihovic; Sotirios Fragkostefanakis; Enrico Schleiff; Stefan Simm; Alternative splicing in tomato pollen in response to heat stress, DNA Research, 2016, 24(2): 205-217
Sotirios Fragkostefanakis; Anida Mesihovic; Yangjie Hu; Enrico Schleiff; Unfolded protein response in pollen development and heat stress tolerance, Plant Reprod, 2016, 29(1-2): 81-91
Jieun Shin; Shenxiu Du; Nora Bujdoso; Yangjie Hu; Seth J. Davis; Overexpression and loss-of-function at TIME FOR COFFEE results in similar phenotypes in diverse growth and physiological responses, J. Plant Biol, 2013, 56(3): 152-159
招生招聘:
· 课题组招聘博士后和科研助理,热忱欢迎具有植物学,遗传学,农学,发育生物学或生物信息学等相关背景的有志青年入驻加盟。简历初审合格者将邮件通知面试,对申请者信息严格保密。
· 热忱欢迎对本研究方向有兴趣的同学报考博士研究生和硕士研究生(每年接收2名博士生,2-3名硕士生);
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