徐永镇教授、博士生导师

学科专业

生物化学与分子生物学

研究方向

RNA剪接与疾病

实验室位置

生科院大楼1130室

联系电话

Email

yongzhen.xu@whu.edu.cn

学习经历

1989-1996 安徽农业大学 本科、硕士

1996-1999 中国科学院上海生物化学研究所博士


主要工作经历与任职情况

1999-2000 中国科学院上海生物化学研究所 研究助理

2000-2008 美国爱因斯坦医学院 博士后、研究助理

2008-2018 中国科学院上海植物生理生态研究所 研究员(杰青)

2018- 武汉大学生命科学学院 教授


主要社会兼职

2011-今 中国生物化学与分子生物学会RNA专业委员会委员

2014-2018 中国科学院植物生理生态研究所学位委员会副主任

2015-2018 中国科学院植物生理生态研究所学术委员会委员

2015-2018 中国科学院昆虫发育与进化生物学重点实验室副主任

2018-今 Science Bulletin生命科学副主编


主要研究领域及兴趣

高等生物中数量巨大的内含子需要通过RNA剪接加以去除。RNA剪接是真核生物转录后加工的必需步骤,其形式多样,是基因表达调控的重要手段。RNA剪接的多样性与细胞分化、器官发育等生命过程密切相关,剪接紊乱则是导致多种疾病发生的重要原因。目前研究方向主要包括:

1)多种形式的RNA剪接发生机制,如alternative splicing, trans-splicing, back-splicing, minor splicing;

2)RNA剪接调控的发育、疾病机制,包括果蝇发育和人类神经、代谢、肿瘤等疾病;

3)内含子中高度保守基序的进化与功能;

4)剪接保真性与转录加工的耦联机制。


主持课题项目

人才项目:

2016-2020 国家自然科学基金委‘国家杰出青年科学基金’

2009-2011 上海市科委‘浦江人才’

科研项目:

2015-2017 中国科学院重点部署项目“剪接体复合物的高效表达系统与作用机制研究”,首席

2015-2017 国家自然科学基金重大研究计划“长非编码RNA表达的剪接调控机制”,主持


发表的论文(*通讯作者)

1) Qiu C, Zhang Y, Fan YJ, Pang TL, Su Y, Zhan S*, Xu YZ* (2018). HITS-CLIP reveals sex-differential RNA binding and alterative splicing regulation of SRm160 in Drosophila.Journal of Molecular Cell Biology, in press.

2) Tang Q, Rodriguez-Santiago S, Wang J, Pu J, Yuste A, Gupta V, Moldón A, Xu YZ*, Query CC* (2016). SF3B1/Hsh155 HEAT motif mutations affect interaction with the spliceosomal ATPase Prp5, resulting in altered branch site selectivity in pre-mRNA splicing.Genes & Development30(24): 2710-2723.

3) Gao JL, Fan YJ, Wang XY, Zhang Y, Pu J, Li L, Shao W, Zhan S, Hao J, Xu YZ* (2015). A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila.Genes & Development29(7): 760-771.

4) Qiu C, Liu WY*, Xu YZ* (2015). Fluorescence labeling of short RNA by oxidation at the 3'-end.Methods in Molecular Biology1297: 113-120.

5) Wang XY, Zheng ZZ, Song HS, Xu YZ* (2014). Conserved RNA cis-elements regulate alternative splicing of Lepidopteran doublesex.Insect Biochemistry and Molecular Biology44(1), 1-11.

6) Zhang ZM, Yang F, Zhang J, Tang Q, Li J, Gu J, Zhou J*, Xu YZ* (2013). Crystal structure of Prp5p reveals interdomain interactions that impact spliceosome assembly.Cell Reports5, 1269-1278.

7) Yang F, Wang XY, Zhang ZM, Pu J, Fan YJ, Zhou J, Query CC, Xu YZ* (2013). Splicing proofreading at 5' splice sites by ATPase Prp28p.Nucleic Acids Research41(8), 4660-4670.

8) Shao W, Zhao QY, Wang XY, Xu XY, Li MW, Li X* and Xu YZ* (2012). Alternative splicing and trans-splicing events revealed by analysis of the Bombyx mori transcriptome.RNA18(7), 1395-1407.

9) Shao W, Kim HS, Cao Y, Xu YZ*, Query CC* (2012). A U1–U2 snRNP interaction network during intron definition.Molecular and Cellular Biology32(2), 470-478.

10) Xu YZ and Query CC (2007). Competition between the ATPase Prp5 and branch region-U2 snRNA pairing modulates the fidelity of spliceosome assembly.Molecular Cell28(5), 838-849.

11) Xu YZ, Newnham CM, Kameoka S, Huang T, Konarska MM and Query CC (2004). Prp5 bridges U1 and U2 snRNPs and enables stable U2 snRNP association with intron RNA.The EMBO Journal23(2), 376-385.

职称 教授、博士生导师 实验室地址 生科院大楼1130室
联系电话 Email yongzhen.xu@whu.edu.cn
入选时间 学科专业 生物化学与分子生物学
研究方向 RNA剪接与疾病

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